Émerson nasceu em Esteio em 3 de julho de 1980 e fez sua formação no Grêmio, clube que o revelou para o futebol profissional em 1999. A partir dali, passou a integrar o elenco do Tricolor e permaneceu no clube até 2004.

O principal título da passagem pelo Grêmio veio em 2001, quando ele fez parte do elenco campeão da Copa do Brasil. Segundo o site O Gol, o volante disputou 108 partidas e marcou cinco gols com a camisa gremista.

Em 2004, ele passou pelo Sport e, em novembro daquele ano, voltou ao Grêmio. O retorno, porém, durou pouco: o departamento médico do clube detectou uma alteração cardíaca, e o jogador foi afastado dos trabalhos. Naquele momento, Émerson tinha 24 anos e vivia o começo da carreira como profissional.

Ele só voltou a jogar em 2007, depois de ser liberado pelos médicos do Grêmio. A liberação, no entanto, não significou a permanência no Tricolor. Na retomada da carreira, o volante seguiu para o Juventude, e depois defendeu Novo Hamburgo, Madureira, América-RN, Canoas e Novo Horizonte.

Os problemas cardíacos marcaram a carreira de Émerson desde cedo. O afastamento em 2004 interrompeu a trajetória no Grêmio, e a internação em outubro de 2026, após o infarto durante o jogo, aconteceu antes da morte do ex-jogador.